Goedkope DNA-analyse

Bio(medische) technologie - Chemische technologie - Elektrotechniek

Chip ontcijfert genoom voor duizend dollar

maandag 16 januari 2012Het Amerikaanse bedrijf Life Technologies brengt een apparaat op de markt dat een menselijk genoom voor 1000 dollar (780 euro) kan ontcijferen. De lage kosten beloven nieuwe klinische toepassingen voor het sequencen van DNA.

De werking van de Ion Proton Sequencer, zoals het apparaat van Life Technologies heet, verschilt sterk van conventionele scanners.

De gangbare techniek maakt gebruik van speciale chemische labels die zich aan nucleotiden, de bouwstenen van DNA, hechten. De labels worden vervolgens optisch gedetecteerd.

De technologie van Life Technologies werkt volledig elektronisch; dure chemicaliën en optische componenten zijn niet nodig.

Het apparaat beschikt over een chip met meer dan een miljoen putjes, waarin DNA-monsters worden geplaatst. Deze chip wordt blootgesteld aan een oplossing met daarin één van de vier nucleobasen.

Wanneer een nucleotide uit de oplossing zich aan een nucleotide in het monster bindt, komt er een waterstofion vrij. Hierdoor verandert de pH-waarde in de putjes en daarmee de elektrische geleiding. Op basis van de elektrische weerstand bepaalt het systeem hoeveel nucleotiden van een bepaald type het monster bevat.

Het nieuwe systeem is niet alleen goedkoop, maar werkt bovendien snel. Bestaande apparaten hebben enkele dagen tot weken nodig om een menselijk genoom te ontcijferen, terwijl de Ion Proton Sequencer aan enkele uren genoeg heeft, claimt Life Technologies.